Научно-исследовательская деятельность в Казанском государственном аграрном университете выполняется в соответствии основным направлениям, обозначенным в долгосрочной Стратегии развития Казанского ГАУ и Приоритетным направлениям развития науки и техники. При этом она характеризуется многоаспектностью и множественностью научных интересов профессорско-преподавательского состава и выполняются в тесной связи с образовательным процессом в рамках сформированных научных школ.
Основными и приоритетными направлениями развития научно-исследовательской деятельности в университете являются:
— организационно-экономические основы и механизмы инновационного функционирования АПК, развития консультационной деятельности в аграрной отрасли;
— ресурсо- и энергосберегающие технологии возделывания экологически безопасной продукции сельского хозяйства на основе биологизации земледелия, системы воспроизводства и повышения плодородия почв, защита почвенного покрова от всех видов деградации;
— сохранение и улучшение генофонда растений и животных;
— интенсификация машинных технологий и техники для производства основных групп продовольствия в сельском хозяйстве;
— создание экологически устойчивых и продуктивных агроландшафтов на основе применения лесомелиорации и аэрокосмического мониторинга и др.